Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP1-5Q9BYS1 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms