Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ATP1A4Q13733 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.3 ms