Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FHL3Q13643 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FHL3Q13643 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
FHL3Q13643 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FHL3Q13643 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FHL3Q13643 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms