Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPROQ16827 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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PTPROQ16827 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPROQ16827 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPROQ16827 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPROQ16827 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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PTPROQ16827 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPROQ16827 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPROQ16827 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPROQ16827 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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PTPROQ16827 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPROQ16827 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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