Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
E2F4Q16254 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
E2F4Q16254 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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