Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
HERC1Q15751 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
HERC1Q15751 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms