Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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TOP3AQ13472 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
TOP3AQ13472 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TOP3AQ13472 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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