Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
DUSP4Q13115 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
DUSP4Q13115 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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