Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.5 ms