Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
UBXN7O94888 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms