Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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