Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BCANQ96GW7 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BCANQ96GW7 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BCANQ96GW7 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BCANQ96GW7 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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