Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TMIEQ8NEW7 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms