Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
HIF1AQ16665 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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