Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TUBB3Q13509 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms