Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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HOXA3O43365 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXA3O43365 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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