Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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SNX13Q9Y5W8 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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SNX13Q9Y5W8 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX13Q9Y5W8 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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