Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EHD3Q9NZN3 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EHD3Q9NZN3 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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