Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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VN1R3Q9BXE9 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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VN1R3Q9BXE9 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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VN1R3Q9BXE9 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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VN1R3Q9BXE9 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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VN1R3Q9BXE9 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
VN1R3Q9BXE9 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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VN1R3Q9BXE9 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
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VN1R3Q9BXE9 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VN1R3Q9BXE9 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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