Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RBM42Q9BTD8 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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