Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RABGGTAQ92696 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RABGGTAQ92696 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms