Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
FOXD1Q16676 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
FOXD1Q16676 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms