Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATP6AP1Q15904 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms