Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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TTF1Q15361 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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TTF1Q15361 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TTF1Q15361 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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