Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
COL9A3Q14050 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
COL9A3Q14050 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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