Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TRIM28Q13263 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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