Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1Q9UJ41 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms