Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXC10Q9NYD6 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXC10Q9NYD6 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXC10Q9NYD6 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXC10Q9NYD6 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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HOXC10Q9NYD6 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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HOXC10Q9NYD6 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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HOXC10Q9NYD6 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HOXC10Q9NYD6 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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