Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TMUB1Q9BVT8 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TMUB1Q9BVT8 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms