Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
FBXO43Q4G163 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms