Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CSPP1Q1MSJ5 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CSPP1Q1MSJ5 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CSPP1Q1MSJ5 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CSPP1Q1MSJ5 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CSPP1Q1MSJ5 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CSPP1Q1MSJ5 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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