Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ERV3-1Q14264 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.5 ms