Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CACNA1SQ13698 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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