Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MKRN3Q13064 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
MKRN3Q13064 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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