Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ECH1Q13011 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ECH1Q13011 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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