Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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RABGEF1Q9UJ41 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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RABGEF1Q9UJ41 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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RABGEF1Q9UJ41 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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RABGEF1Q9UJ41 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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RABGEF1Q9UJ41 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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RABGEF1Q9UJ41 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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