Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SAMD1Q6SPF0 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SAMD1Q6SPF0 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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