Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPROQ16827 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPROQ16827 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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