Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PKN1Q16512 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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