Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
VPS72Q15906 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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