Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NEDD8Q15843 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms