Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SMAD4Q13485 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms