Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CHRNEQ04844 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms