Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CACNB1Q02641 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNB1Q02641 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms