Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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RABGEF1Q9UJ41 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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RABGEF1Q9UJ41 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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RABGEF1Q9UJ41 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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RABGEF1Q9UJ41 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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RABGEF1Q9UJ41 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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RABGEF1Q9UJ41 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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