| CTXN3 | Q4LDR2 | PISRT1.1-201 | ENST00000616930 | 107 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | WARS-244 | ENST00000627608 | 123 nt | TSL 5 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC233981.2-201 | ENST00000611524 | 1614 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GLMN-201 | ENST00000370360 | 1995 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DEUP1-201 | ENST00000298050 | 2664 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EYS-202 | ENST00000342421 | 2168 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DENND4A-202 | ENST00000443035 | 8665 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF736P3Y-201 | ENST00000428264 | 1465 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CYSLTR1-203 | ENST00000614798 | 2681 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP289-201 | ENST00000362332 | 137 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-596P-201 | ENST00000365395 | 98 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR29B2-201 | ENST00000385055 | 81 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | OOSP1P1-201 | ENST00000423265 | 274 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AL513124.1-201 | ENST00000450410 | 614 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF436-AS1-205 | ENST00000518600 | 376 nt | TSL 5 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02165-201 | ENST00000563061 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4658-201 | ENST00000584344 | 65 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC092070.3-201 | ENST00000596041 | 337 nt | TSL 3 BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | U4atac.1-201 | ENST00000618345 | 95 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC112487.2-201 | ENST00000637950 | 304 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC069528.2-201 | ENST00000624849 | 1991 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NEBL-202 | ENST00000377122 | 9216 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.384-201 | ENST00000383909 | 102 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1304P-201 | ENST00000411374 | 106 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNRPEP8-201 | ENST00000442866 | 260 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL7P42-201 | ENST00000481005 | 679 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC145146.1-201 | ENST00000496370 | 254 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC063944.1-201 | ENST00000496943 | 295 nt | TSL 3 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FGF7P4-201 | ENST00000509595 | 295 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR3923-201 | ENST00000579521 | 83 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP000654.2-201 | ENST00000605633 | 586 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC064859.1-201 | ENST00000624741 | 174 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PCM1-222 | ENST00000524226 | 5955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KPNA2P1-201 | ENST00000458289 | 1591 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC114316.2-202 | ENST00000502934 | 2957 nt | TSL 2 BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LIG4-203 | ENST00000442234 | 3982 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | COMMD6-201 | ENST00000355801 | 486 nt | TSL 2 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.387-201 | ENST00000383918 | 102 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.533-201 | ENST00000384596 | 114 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA75.4-201 | ENST00000391278 | 119 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL359511.1-201 | ENST00000402970 | 211 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4ATAC16P-201 | ENST00000408512 | 126 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP494-201 | ENST00000410653 | 129 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC012306.1-201 | ENST00000423267 | 114 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC133865.1-201 | ENST00000438619 | 339 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | snoU13.6-201 | ENST00000458785 | 104 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HYDIN2-201 | ENST00000493714 | 554 nt | TSL 4 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU4ATAC7P-201 | ENST00000516280 | 125 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP24-201 | ENST00000516478 | 95 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1213P-201 | ENST00000517075 | 94 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009754.1-201 | ENST00000566282 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FRG2DP-202 | ENST00000566967 | 323 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CYP4A27P-201 | ENST00000567218 | 190 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC002558.3-201 | ENST00000574021 | 401 nt | TSL 3 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL355375.2-201 | ENST00000574825 | 175 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LARP7P1-201 | ENST00000605576 | 316 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DEUP1-202 | ENST00000525646 | 1920 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EXOC6-203 | ENST00000371552 | 3564 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MAP4K3-205 | ENST00000437545 | 3924 nt | TSL 5 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | APCS-201 | ENST00000255040 | 926 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.48-201 | ENST00000362710 | 103 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR95-201 | ENST00000385072 | 81 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MT-TD-201 | ENST00000387419 | 68 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.597-201 | ENST00000410463 | 100 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SKP123-201 | ENST00000410732 | 291 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NCOA7-AS1-201 | ENST00000429007 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC002386.1-201 | ENST00000436714 | 398 nt | TSL 2 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009969.1-201 | ENST00000438726 | 172 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC073325.1-201 | ENST00000443714 | 542 nt | TSL 4 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SL297P-201 | ENST00000483161 | 293 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RN7SL636P-201 | ENST00000497504 | 294 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND3P22-201 | ENST00000510932 | 243 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP005062.1-201 | ENST00000581502 | 607 nt | TSL 3 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR5092-201 | ENST00000583139 | 88 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | B3GNTL1P2-201 | ENST00000603673 | 288 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6ATAC35P-201 | ENST00000609276 | 444 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC138058.1-201 | ENST00000620572 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL669831.3-213 | ENST00000636676 | 183 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC242426.3-202 | ENST00000607149 | 2397 nt | TSL 5 BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AASDH-207 | ENST00000513376 | 3241 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU5B-2P-201 | ENST00000363036 | 113 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP456-201 | ENST00000364002 | 114 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-944P-201 | ENST00000364023 | 107 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FAM206A-202 | ENST00000374624 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |