Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TPRNQ4KMQ1 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms