Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PDCD1Q15116 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms