Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHPRHQ149N8 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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SHPRHQ149N8 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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SHPRHQ149N8 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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SHPRHQ149N8 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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SHPRHQ149N8 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
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SHPRHQ149N8 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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SHPRHQ149N8 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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SHPRHQ149N8 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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SHPRHQ149N8 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SHPRHQ149N8 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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