Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMC1AQ14683 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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